- L'échantillon, aussi petit que possible, doit être placé sur une lame porte-objet dans une petite goutte de liquide (eau ou glycérine) et recouvert d'une lamelle couvre-objet.

- La préparation devra être explorée en déplaçant très lentement la lentille tout en observant.

Il est utile de réaliser un dessin de ses observations, au trait, en ne faisant apparaître que le principal. C'est ainsi que les observations de A. Van Leeuwenhoek, de R. Hooke et de T. Schwann sont parvenues jusqu'à nous...

Les cellules mesurent, en général, quelques dizaines de micromètres (1 µm = 1/1000 de mm). Les exemples indiqués ici concernent des cellules particulièrement grandes ou faciles à préparer.

Couper en deux une pomme de terre et prélever un fragment le plus fin possible de la chair avec une lame de rasoir tenue tangentiellement à la surface. Déposer le fragment sur une lame, ajouter une goutte de teinture d'iode, d'alcool iodé ou de désinfectant à base d'iode très dilués. Presser légèrement sur la lamelle pour ne pas la casser. Les cellules contiennent des petits grains d'amidon colorés en bleu par l'iode.

Procéder comme pour la Pomme de terre. Les réserves incluses dans ces cellules sont également constituées d'amidon, principale substance de réserve des végétaux.

Ouvrir une tomate en deux et prélever avec la pointe d'un couteau un tout petit peu de gelée à proximité des graines en prenant garde de ne pas prendre de graine. Déposer l'échantillon sur la lame, recouvrir d'une lamelle et presser légèrement pour que l'échantillon s'étale entièrement sous la lamelle. On observe de très grandes cellules contenant un petit noyau ainsi que des cristaux d'un pigment rouge. C'est la gélification de la paroi de ces cellules au cours de la maturation du fruit qui constitue la "gelée" située entre les graines.

Prendre un Oignon et le couper en quatre. Enlever une des écailles et avec une pince à épiler, soulever la mince pellicule qui tapisse intérieurement chaque écaille (c'est son épiderme interne). Découper un fragment de quelques mm de côté et le déposer sur une lame dans une goutte d'eau. Recouvrir d'une lamelle. Les cellules jointives sont imbriquées comme les briques dans un mur.

Faire une incision peu profonde à la surface d'un pétale de fleur (Tulipe, Rose, Lis etc.) avec une lame de rasoir et saisir avec une pince à épiler une petite partie de l'épiderme. Procéder ensuite comme pour l'Oignon. Les cellules sont imbriquées comme les pièces d'un puzzle.

Recueillir un peu de la poussière verte qui tapisse souvent les troncs d'arbre, même en ville. En déposer un peu sur une goutte d'eau. Poser une lamelle. Observer les cellules qui appartiennent à une espèce d'algues unicellulaires. On découvrira un gros organite, le chloroplaste, qui a une couleur verte (due à la chlorophylle qu'il contient) et qui réalise la photosynthèse. Essayer la coloration par l'iode.

On notera que toutes les cellules précédentes, d'origine végétale, sont entourées par une paroi épaisse (faite surtout de cellulose) qui double leur membrane et est bien visible en raison de son épaisseur contrairement à la membrane invisible.

Toutes sortes d'autres échantillons sont facilement observables et nous en donnons quelques exemples à titre indicatif car nous ne pouvons tous les détailler :

Spores de champignons recueillies sous le chapeau, spores de Fougères (sous les feuilles), algues filamenteuses des mares et ruisseaux, feuilles de mousses, épiderme de feuilles diverses (Misère, Poireau) prélevé avec la technique indiquée pour l'Oignon, poils urticants d'Ortie, pollen de fleur, chair de Carotte. Les cellules animales sont, en général, plus difficiles à observer car plus petites et plus fragiles.

Divers produits courants peuvent être utilisés comme colorant : éosine, mercurochrome, alcool iodé ou teinture d'iode, encre bleue. Il sera souvent nécessaire de diluer le colorant avec de l'eau : c'est par tâtonnement que vous déterminerez la meilleure dilution. Il est également intéressant de colorer divers échantillons identiques avec ces différents produits car ils ne se fixent pas sur les mêmes structures cellulaires. On peut ainsi comparer les différentes observations.